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Licencias médicas: control administrativo y trazabilidad mínima

Qué revisar en recepción, plazo de entrega, respaldo y cierre interno para que una licencia médica no se convierta en un problema de coordinación.

Perfil de lecturaRRHH, administración y jefaturas

Una guía breve para ordenar recepción, seguimiento y cierre de licencias médicas sin mezclar conceptos ni perder trazabilidad.

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¿Qué es una licencia médica y quién la otorga?

La licencia médica es el derecho del trabajador a ausentarse del trabajo por razones de salud, respaldado por un certificado médico que autoriza el reposo. En Chile puede ser otorgada por médicos, cirujanos-dentistas o matronas con acceso al sistema de licencias médicas electrónicas.

  • La licencia puede ser de reposo total o parcial (jornada reducida)
  • Puede ser preventiva, curativa o de accidente de trabajo
  • El certificado médico se emite directamente en el sistema digital (no necesitas trámites adicionales si el médico usa el sistema electrónico)
  • Si el médico emite en papel, tienes hasta 2 días hábiles para presentarla al empleador y hasta 3 días para que el empleador la tramite ante la Isapre/Fonasa

Plazos críticos para tramitar la licencia

Los plazos son estrictos y su incumplimiento puede significar el rechazo de la licencia:

AcciónPlazoResponsable
Presentar licencia al empleador2 días hábiles desde inicio del reposoTrabajador
Empleador tramita ante Isapre/Fonasa3 días hábiles desde recepciónEmpleador
Isapre/Fonasa resuelve autorización3 días hábilesIsapre/Fonasa
Pago del subsidioDentro de los 3 días hábiles del mes sig.Isapre/Fonasa
⚠️ Si vences el plazo

La Isapre o Fonasa puede rechazar la licencia por presentación fuera de plazo. Si esto ocurre, puedes apelar presentando justificación documentada de la demora.

¿Cuánto se paga durante la licencia médica?

Durante la licencia médica, el trabajador recibe un subsidio de incapacidad laboral, que no paga el empleador sino la Isapre o Fonasa. El monto depende del promedio de remuneraciones de los últimos 3 meses.

  1. Se calcula el promedio de remuneraciones imponibles de los últimos 3 meses
  2. El subsidio equivale a ese promedio, con tope de 126,53 UF mensuales
  3. Los primeros 3 días de licencia los paga el empleador (si la licencia es superior a 3 días, Fonasa/Isapre paga desde el día 1 retroactivamente)
  4. Si la licencia dura más de 6 meses, puede requerir extensión y evaluación del Compin

💡 Importante

El subsidio de licencia médica no incluye variables ni bonos habituales que no sean considerados en el cálculo base. Si tienes remuneraciones variables altas, el subsidio puede ser menor a tu sueldo habitual.

Licencia por enfermedad grave de hijo menor de 1 año

El permiso de enfermedad grave de hijo menor de 1 año es un caso especial: el padre o la madre pueden tomar la licencia (no necesariamente quien tiene el vínculo laboral con el niño/a). Se puede turnarse o transferir el derecho.

  • Aplica mientras el niño/a tenga menos de 1 año y requiera atención en el hogar o esté hospitalizado
  • La madre puede transferirlo al padre desde la octava semana del postnatal
  • Los subsidios los paga Fonasa/Isapre según el caso
  • El empleador no puede despedir al trabajador mientras dure la licencia por esta causa

¿El empleador puede exigir presentarse estando con licencia?

No. La licencia médica exime al trabajador de toda obligación de concurrir al trabajo o de responder comunicaciones laborales durante el período de reposo. El empleador que exige esto comete una infracción a la Ley 16.744 y al Código del Trabajo.

¿Me pueden despedir mientras estoy con licencia?

No directamente por la licencia. Sin embargo, si existe una causal previa válida (ej. necesidades de la empresa) el despido puede proceder, pero la fecha de término no puede coincidir con los días de licencia. En la práctica, es muy difícil que el despido prospere en este período.

¿La licencia interrumpe las vacaciones?

Sí. Si comienzas a gozar de vacaciones y luego caes con licencia médica, las vacaciones se suspenden desde el inicio de la licencia. Los días de licencia no se descuentan del feriado legal.

¿Fonasa paga igual que Isapre en una licencia?

El mecanismo es similar, pero el tope del subsidio y la oportunidad del pago puede variar. Fonasa paga vía COMPIN y puede demorarse más. Isapre tiene sus propios plazos según el contrato de salud.

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